Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GcsamQ6RFH4 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms