Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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