Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Q3U6N9 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms