Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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