Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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