Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcanP55066 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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NcanP55066 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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NcanP55066 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcanP55066 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
NcanP55066 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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