Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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