Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms