Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprmP28828 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprmP28828 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprmP28828 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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