Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Lipc-201ENSMUST00000034731 1920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm27034-201ENSMUST00000182552 940 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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