Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms