Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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