Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms