Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
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