Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SbsnQ8CIT9 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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