Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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