Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc17Q8CE13 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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