Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 686.1 ms