Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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Dsg1bQ7TSF1 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Dsg1bQ7TSF1 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Dsg1bQ7TSF1 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Dsg1bQ7TSF1 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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