Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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