Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Tff3Q62395 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms