Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm22484-201ENSMUST00000157992 306 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfp493-203ENSMUST00000181319 730 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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