Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms