Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 449.2 ms