Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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