Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ttc21bQ0HA38 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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