Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Top2aQ01320 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms