Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Sh3bp1P55194 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
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