Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms