Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VhlP40338 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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VhlP40338 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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VhlP40338 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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VhlP40338 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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VhlP40338 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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VhlP40338 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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VhlP40338 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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VhlP40338 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
VhlP40338 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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