Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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