Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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