Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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