Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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