Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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