Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29577-201ENSMUST00000186427 693 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Mir185-201ENSMUST00000083530 65 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Ucn3-201ENSMUST00000058610 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AW822252-205ENSMUST00000192662 1352 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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