Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TP20293 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TP20293 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TP20293 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TP20293 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TP20293 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TP20293 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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