Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms