Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Defa1P11477 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms