Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms