Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms