Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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H2-Q1O19441 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
H2-Q1O19441 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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H2-Q1O19441 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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H2-Q1O19441 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Q1O19441 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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H2-Q1O19441 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Q1O19441 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Q1O19441 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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H2-Q1O19441 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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H2-Q1O19441 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Q1O19441 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Q1O19441 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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H2-Q1O19441 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Q1O19441 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Q1O19441 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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H2-Q1O19441 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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