Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Parva-203ENSMUST00000106643 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Osbpl1a-202ENSMUST00000117361 2687 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Ap3b1-201ENSMUST00000022196 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Ece2-208ENSMUST00000120394 3432 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Wdr59-203ENSMUST00000211981 3618 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Prg4-202ENSMUST00000111901 3495 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm7546-202ENSMUST00000211354 275 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 AC151982.1-201ENSMUST00000223546 464 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Mill2-205ENSMUST00000227379 1998 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm2056J3QQ02 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms