Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm13944-202ENSMUST00000146495 542 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm44033-201ENSMUST00000203699 695 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Snora65-201ENSMUST00000083190 130 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm13576-201ENSMUST00000120851 778 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms