Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Brinp3-205ENSMUST00000166814 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Ugt1a6b-202ENSMUST00000113138 2303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Def8-205ENSMUST00000108832 3242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Def8-201ENSMUST00000001522 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC124709.1-201ENSMUST00000227296 620 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gsdmc2-203ENSMUST00000188691 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms