Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf4Q9QZS2 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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