Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Zfp637-204ENSMUST00000112861 1202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Swi5-202ENSMUST00000113395 712 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm12320-201ENSMUST00000127333 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm8877-201ENSMUST00000172657 655 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm8868-201ENSMUST00000173591 577 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 1700041I07Rik-201ENSMUST00000197536 435 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 C230072F16Rik-201ENSMUST00000219184 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Zfp637-211ENSMUST00000223041 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Zdhhc22-201ENSMUST00000095521 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Asic5-202ENSMUST00000107736 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 2310005A03Rik-201ENSMUST00000142569 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr923-203ENSMUST00000213619 2846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Ccdc36-201ENSMUST00000076592 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm13666-201ENSMUST00000120032 799 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm15873-201ENSMUST00000123390 761 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 1700003M07Rik-201ENSMUST00000139884 541 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 H2-Aa-204ENSMUST00000174751 826 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm19402-201ENSMUST00000180297 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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