Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms