Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms