Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms